El proyecto está liderado por Fernando González, catedrático de Genética de la Universitat de València e investigador en el Instituto de Biología Integrativa de Sistemas y en FISABIO, e Iñaki Comas (Instituto de Biomedicina de Valencia). En él participarán más de 40 unidades de microbiología clínica de hospitales de toda España y centros de secuenciación. La plataforma Salud Global del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), cofinanciada por la Fundación MAPFRE, ha seleccionado el proyecto, junto con otros 11, como parte de las iniciativas para abordar la pandemia de Covid-19.
El proyecto de investigación Addressing unknowns of COVID-19 transmission and infection combining pathogen genomics and epidemiology to inform public health interventions tiene un presupuesto de 740.800 euros, y su objetivo es el estudio comparado de los genomas del nuevo coronavirus de los pacientes con la enfermedad Covid-19 para entender y predecir su evolución y epidemiología en el espacio y el tiempo.
La iniciativa la llevarán a cabo investigadores del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), perteneciente al CSIC y a la Universitat de València; del Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV), del CSIC; así como de la Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica (FISABIO) de la Generalitat Valenciana.
Iñaki Comas, científico del CSIC en el IBV e investigador principal del proyecto, explica que este proyecto permitirá incorporar la epidemiología genómica como una herramienta para entender el curso de la epidemia, cómo se originó y cómo está evolucionando en el tiempo y en el espacio. Destaca además que esta investigación no tiene solamente un aspecto académico, sino que también plantea el reto de generar resultados que sirvan para informar a las autoridades de salud pública. Por su parte, Fernando González Candelas, investigador del I2SysBio y de FISABIO, ha destacado la escala geográfica del proyecto que abarca hospitales de toda España y señala que “si bien hay una afectación general por COVID-19, la realidad es que cada comunidad está en una fase epidémica diferente y, por tanto, las soluciones a medio plazo han de ser diferentes”.
Los datos generados serán depositados en repositorios públicos, así como en la plataforma global NextStrain (nextstrain.org) de la que se ha derivado un nodo español que ya está integrando los datos de secuencias españolas (nextspain.uv.es). La plataforma implementa herramientas de visualización muy potentes para poder seguir la evolución del virus en el espacio y en el tiempo. Ambos investigadores responsables del proyecto, especialistas en epidemiología genómica, destacan la potencia de la combinación de los datos genómicos, la microbiología clínica, la epidemiología y la filogenética. “La epidemiología genómica representará a las enfermedades infecciosas en el siglo XXI, lo que representaron las vacunas en el siglo XIX o los antibióticos en el siglo XX”, ha añadido Iñaki Comas.
Plataforma Temática Interdisciplinar (PTI)
Este proyecto ha sido financiado, junto con otros 11, por la Plataforma Temática Interdisciplinar (PTI) Salud Global del CSIC, en la que colaboran más de 150 grupos de investigación y que cuenta con el apoyo de la Fundación MAPFRE. Jesús Marco, vicepresidente de Investigación Científica y Técnica del CSIC, ha destacado que “una de las claves de esta PTI Salud Global es contar con una visión global que permita enlazar todos los aspectos de la pandemia: origen, prevención, enfermedad, medidas de contención, tratamiento, impacto social, y por último la necesidad de comunicación a la sociedad, en particular en educación”. La plataforma, impulsada desde la Vicepresidencia de Investigación Científica y Técnica del CSIC, está coordinada por la investigadora del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO) Margarita del Val, apoyada por un comité de expertos en las diferentes áreas implicadas.
Pie de foto:
nextspain.uv.es es la plataforma de análisis de datos derivados de secuencias españolas basada en la plataforma internacional nextstrain.org. Integra el análisis genómico y filogenético (izquierda) de las secuencias para inferir patrones de movimiento geográfico (derecha). Crédito: Giuseppe d’Auria, FISABIO.
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